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“构建这种泛基因组最重要的发现之一是标记为TomLoxC

2019-07-10 09:38:16男性资讯

众所周知,从超市过道采摘的西红柿并不像花园里的新鲜食品或当地市场那样美味。这种差异是番茄种植者选择的基因可以帮助水果在长途旅行中存活,在此过程中牺牲品味。为了找到可以拼接回商业作物的味道基因,研究人员现在已经编制了所有栽培和相关野生番茄品种的泛基因组,揭示了近5,000个以前未知的基因。

国内番茄基因组在2012年完全测序,但这只是一个特殊的品种,被称为亨氏1706。最近的研究工作已经用于研究其他品种,包括更美味的传家宝西红柿,然而它们在现代繁殖之前商业化生产的水果,有利于外观和保质期。

这项新工作将这种观点扩展到所有定期种植的番茄品种及其最近亲属的完整基因组。这包括来自725种不同类型番茄的所有基因,并且在此过程中,该团队发现了额外的4,873个基因,这些基因未包括在Heinz 1706基因组基因组中。

这为种植者提供了大量新工具,可用于种植更美味,更健康或更持久的西红柿。就风味而言,一个基因特别引起了他们的注意。TomLoxC被发现通过产生更多的一些类胡萝卜素来增加西红柿的花香和果香。

“构建这种泛基因组最重要的发现之一是标记为TomLoxC的罕见基因形式,其DNA基因启动子的版本大多不同,”该研究的共同作者James Giovannoni说。“该基因通过催化许多脂质(脂肪) - 挥发物的生物合成来影响水果的味道 - 这些化合物容易蒸发并有助于香气。”

这种形式的TomLoxC只有2%的传家宝番茄品种出现,但在90%以上的较小的野生番茄中发现了它。有趣的是,该团队发现该基因的这一版本开始出现在番茄的新品种中。虽然这个基因的作用刚刚被发现,但育种者似乎对这些事情有所了解。

Giovannoni说:“在西红柿的驯化早期,似乎存在强烈的选择压力,或者至少没有选择这种版本的TomLoxC。” “这种形式在现代西红柿中流行的增加可能反映了育种者对改善风味的新兴趣。”

研究人员表示,获取有关如此多番茄品种基因组的详细数据将有助于育种者设计更美味的作物,这些作物仍保留基因,使其能够远距离运送到超市。如果科学家想要真正有创意,他们也可能会开始制作辣番茄。